Algunas de sus 2.096 celdas también alojaron presos políticos. En el año 2000 se decidió su cierre porque se la consideraba inhumana . Los últimos detenidos, alojados en la cárcel vieja que da hacia avenida Caseros, fueron trasladados en agosto de 2001. Y en 2002 sirvió como escenario real del unitario “Tumberos” , que produjo Ideas del Sur, dirigió Israel Adrián Caetano y, con Germán Palacios y Carlos Belloso como protagonistas, se emitió por América con gran éxito de audiencia.

Después comenzó otra pelea, acerca de cuál era la técnica más adecuada para tirar abajo un edificio inexpugnable , construido en hierro y hormigón . La decisión de ocasionar una implosión fue resistida con éxito por los vecinos, que presentaron un recurso de amparo y frenaron los trabajos argumentando que la nube de polvo afectaría sus casas y a los hospitales Garrahan y Udaondo.

Finalmente, a mediados de 2006 se firmó un convenio con el Ejército por $ 7 millones para que se ocupara de demoler el edificio piso por piso . Trabajaron 75 operarios, entre contratistas y militares, que usaron taladros neumáticos y mini cargadoras con palos y martillos de demolición. La obra terminó a principios de 2008.

Como la Ciudad jamás demolió el muro perimetral ni urbanizó el predio, el año pasado, el Organismo Nacional de Administración de Bienes del Estado (Onabe), dejó sin efecto un acuerdo con el Gobierno porteño y cedió el terreno para la construcción de la sede del Archivo General de la Nación.