Con poco más del 20% de las 5309 mesas escrutadas, el sí obtenía el 80,64% de los votos, contra el 18,08% del no, con 0,46% de votos en blanco, 0,82% de sufragios nulos y 9,93% de asistencia a las urnas, según datos divulgados por el Tribunal Superior de Justicia Electoral (TSJE) menos de una hora después del cierre de los comicios.

La votación se caracterizó por la ausencia de incidentes y por la baja concurrencia a las urnas, que resultó muy inferior a la que habían pronosticado tanto las autoridades como los analistas, del orden de 40% de un electorado de alrededor de tres millones de ciudadanos.

El presidente de Paraguay, Fernando Lugo, afirmó que los paraguayos decidieron "dar un paso cívico como nación, al escribir esa página demorada en la historia, abriendo las puertas a los hermanos y hermanas" que hasta ahora habían sido "postergados en su derecho a elegir el destino de su país".

El referéndum contó con la supervisión de 13 observadores de la Organización de los Estados Americanos (OEA), encabezados por la canciller colombiana, Noemí Sanín.

El triunfo del sí representaría la primera enmienda a la Constitución de 1992, que fue elaborada en pleno proceso de transición democrática tras la caída de la dictadura de Alfredo Stroessner (1954-1989)..