Cuenta actualmente con un plantel inferior a 60 personas. Entre las actividades que desarrolla se encuentra el mantenimiento del balizamiento luminoso (eléctrico) del río Uruguay, desde la desembocadura (Km 0) hasta Concepción del Uruguay (Km 187), además el acceso al río Gualeguaychú y las cuatro boyas que demarcan la travesía por el vano central del puente internacional General Artigas. Además mantiene el balizamiento ciego dentro del río Gualeguaychú hasta el puerto homónimo y los tramos de la ruta principal que va desde el puente Artigas hasta Concordia. Un total de 140 boyas distribuidas en los 330 kilómetros del río Uruguay.

Otra de las actividades que desarrolla actualmente es el relevamiento hidrográfico con equipo satelital de alta precisión (submétrico) del tramo navegable del río Uruguay desde Punta Gorda a Concordia y el río Gualeguaychú. Se mantiene la red hidrométrica del río Uruguay con 37 hidrómetros que están ubicados a la vera del río desde El Soberbio (Misiones) hasta Punta Gorda (Km 0), más la costa oriental de la laguna del Iberá (Corrientes) y los afluentes más importantes (Miriñay, Mocoretá, Gualeguaychú y Delta Entrerriano). Con información diaria recibida por Prefectura Naval y Gendarmería Nacional más algunos observadores particulares contratadas al efecto. Toda esa información es posteriormente procesada en el Departamento para uso propio o de cualquier organismo público o privado que necesite ese dato. A modo de ejemplo esa información fue requerida para al ejecución del puente Santo Tomé- Sao Borja, la Defensa Sur y la actual obra del puente y costanera sobre la isla del Puerto de nuestra ciudad.

En los talleres propios del Departamento se realiza el mantenimiento de las embarcaciones y vehículos de su propiedad. En el Dique 4, propiedad de esta Dirección se extraen los buques de mediano porte (hasta 50 metros de eslora y calado máximo de 3 metros) de la repartición para su reparación y puesta a punto.